保持水深在40～80厘米。氨氮含量小于每升0.2毫克，溶氧大于每升5毫克，保持水質(zhì)清新。光照強度500～2000勒克斯，光照均勻。根據(jù)要求調(diào)節(jié)水溫和換水量。養(yǎng)殖過程需按時測定水溫、pH值、溶解氧、鹽度、COD、氨氮、亞硝/酸鹽、硝/酸鹽、磷酸鹽等相關(guān)指標，將各項指標控制在合適的范圍內(nèi)。當(dāng)水溫高于20℃時，需要加大地下低溫海水的添加量和循環(huán)水量，并采取加大純氧供給量的措施，使氧氣飽和度達到100～150%（有液氧設(shè)施）。由于夜晚時間比較長，也是魚類生長速度比較快的時段，因此每天傍晚要堅持清潔養(yǎng)殖池一次，并進行一次池底排污操作，給魚苗創(chuàng)造一個良好生長的環(huán)境。
生化模式凈水主要是靠硝化細菌，硝化細菌從無到有這個過程俗稱掛膜。硝化細菌掛膜需要濾材（細菌屋）；硝化細菌屬于好氧細菌，因此需要氧氣；硝化細菌繁殖還需要養(yǎng)分，也就是魚糞。再滿足上訴三個情況下，保持25度水溫，硝化細菌從無到有需要將近35天，15度水溫情況下需要50天或者更久，這個過程叫冷啟動。想快速啟動，可以使用液體硝化細菌，或者添加一些其他已經(jīng)掛膜的濾材進來進行引菌，這個過程叫熱啟動。海水系統(tǒng)應(yīng)為高鹽度的問題，自然掛膜時間比淡水系統(tǒng)要長一倍以上，時間也隨鹽度升高而延長。
工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)中溶解氧是非常重要的，溶解氧是養(yǎng)殖動物氧氣需求的來源，是養(yǎng)殖動物生存及正常生理活動的根本保證。溶解氧可以氧化殘留有機質(zhì)跟水體及池底的有害物質(zhì)，有利于耗氧性微生物生長繁殖，促進有機物降解，減少有毒、有害物質(zhì)的作用，抑制厭氧微生物的活動。總而言之，溶解氧對于水產(chǎn)養(yǎng)殖，是一個重要的因素之一。在養(yǎng)殖中，偶爾會存在溶解氧不足的情況，溶氧不夠無法提高產(chǎn)量甚至?xí)绊懰|(zhì)，這時我們就必須為養(yǎng)殖水里增氧。增氧的方式有很多種，常見的有羅茨風(fēng)機、高壓風(fēng)機、液氧罐、制氧機等等。