循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)難點是解決氮循環(huán)的問題，要消除氨氮和亞硝/酸氮的影響。傳統(tǒng)的解決方案是在循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)中加入了反硝化反應(yīng)池，但由于反硝化作用需要在嚴格厭氧條件下進行，因此硝化作用反應(yīng)池需要跟反硝化作用反應(yīng)池分開，這就增加了循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)的成本。前循環(huán)水養(yǎng)殖設(shè)備已實現(xiàn)工廠化生產(chǎn)，實現(xiàn)養(yǎng)殖池與養(yǎng)殖凈化設(shè)備的無縫連接。通過一系列的物理過濾、化學(xué)沉淀以及通過微生物的作用去除氨氮、硝氮和亞硝氮再通過殺菌消毒、充氧等操作，水體重新流回到循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)中，實現(xiàn)養(yǎng)殖水的循環(huán)利用。
既然是養(yǎng)活物，非常核心的兩個問題，一個是用什么養(yǎng)？即養(yǎng)殖模式，一個是怎么養(yǎng)？養(yǎng)殖管理。養(yǎng)殖模式包括養(yǎng)殖技術(shù)和手段。而養(yǎng)殖管理談的是如何統(tǒng)籌、調(diào)動人、物、水，讓人盡其能，物盡其用，水盡其利。養(yǎng)殖技術(shù)沒什么好說的，養(yǎng)殖業(yè)發(fā)展至今，技術(shù)必然已經(jīng)足夠成熟到可以支撐這個產(chǎn)業(yè)，而手段（循環(huán)水養(yǎng)殖）剛才也已經(jīng)說過了。但有一點是被大多數(shù)人有意或無意忽略了的問題，就是養(yǎng)殖管理。
（recirculating aquaculture system，RAS）作為一種新型養(yǎng)殖模式，通過一系列水處理單元將養(yǎng)殖池中產(chǎn)生的廢水處理后再次循環(huán)回用。其主要原理是將環(huán)境工程、土木建筑、現(xiàn)代生物、電子信息等學(xué)科領(lǐng)域的先進技術(shù)集于一體，以去除養(yǎng)殖水體中殘餌糞便、氨氮（TAN）、亞硝/酸鹽氮（NO2--N）等有害污染物,凈化養(yǎng)殖環(huán)境為目的，利用物理過濾、生物過濾、去除CO2、消毒、增氧、調(diào)溫等處理將凈化后的水體重新輸入養(yǎng)殖池的過程。其不僅可以解決水資源利用率低的問題，還可以為養(yǎng)殖生物提供穩(wěn)定可靠、舒適優(yōu)質(zhì)的生活環(huán)境，為高密度養(yǎng)殖提供了有利條件。