循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)難點(diǎn)是解決氮循環(huán)的問題，要消除氨氮和亞硝/酸氮的影響。傳統(tǒng)的解決方案是在循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)中加入了反硝化反應(yīng)池，但由于反硝化作用需要在嚴(yán)格厭氧條件下進(jìn)行，因此硝化作用反應(yīng)池需要跟反硝化作用反應(yīng)池分開，這就增加了循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)的成本。前循環(huán)水養(yǎng)殖設(shè)備已實(shí)現(xiàn)工廠化生產(chǎn)，實(shí)現(xiàn)養(yǎng)殖池與養(yǎng)殖凈化設(shè)備的無縫連接。通過一系列的物理過濾、化學(xué)沉淀以及通過微生物的作用去除氨氮、硝氮和亞硝氮再通過殺菌消毒、充氧等操作，水體重新流回到循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)中，實(shí)現(xiàn)養(yǎng)殖水的循環(huán)利用。
循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)（recirculating aquaculture system，RAS）作為一種新型養(yǎng)殖模式，通過一系列水處理單元將養(yǎng)殖池中產(chǎn)生的廢水處理后再次循環(huán)回用。其主要原理是將環(huán)境工程、土木建筑、現(xiàn)代生物、電子信息等學(xué)科領(lǐng)域的先進(jìn)技術(shù)集于一體，以去除養(yǎng)殖水體中殘餌糞便、氨氮（TAN）、亞硝（xiao）酸鹽氮（NO2--N）等有害污染物,凈化養(yǎng)殖環(huán)境為目的，利用物理過濾、生物過濾、去除CO2、消毒、增氧、調(diào)溫等處理將凈化后的水體重新輸入養(yǎng)殖池的過程。其不僅可以解決水資源利用率低的問題，還可以為養(yǎng)殖生物提供穩(wěn)定可靠、舒適優(yōu)質(zhì)的生活環(huán)境，為高密度養(yǎng)殖提供了有利條件。
很多人會(huì)問自來水可以進(jìn)行水產(chǎn)養(yǎng)殖嗎，答案是否定的。讓我們來先了解一下魚的免疫系統(tǒng)，魚身體的表皮層內(nèi)長有一種杯狀細(xì)胞，不斷地在分泌著粘液，使魚體減少游在水中的摩擦，同時(shí)，粘液又能保護(hù)魚體不受寄生物、霉菌、細(xì)菌和其他微小生物的侵蝕，并使皮膚具有一種正常的滲透能力。為什么說自來水不適合水產(chǎn)養(yǎng)殖呢，因?yàn)樽詠硭兄饕?quot;氯"的成份。自來水中的氯卻是一種強(qiáng)氧化劑，在水中生成很不穩(wěn)定的強(qiáng)氧化劑---次氯酸。