二代測序——甲基化的定義和概念
定義:甲基化(methylation)是指從活性甲基化合物(如S-腺苷基甲硫氨酸)上將甲基催化轉(zhuǎn)移到其他化合物的過程。在生物系統(tǒng)中,這是一種常見的化學(xué)修飾方式,主要涉及在DNA、RNA和蛋白質(zhì)等生物大分子上添加甲基基團(tuán)。
DNA甲基化
概念及位置:DNA甲基化主要是在DNA甲基轉(zhuǎn)移酶(DNAmethyltransferase,DNMT)的作用下,將甲基基團(tuán)添加到DNA分子中的特定堿基上,最常見的是在CpG島(富含CpG二核苷酸的區(qū)域,CpG是指胞嘧啶-鳥嘌呤的堿基對)的胞嘧啶(C)的5’碳位上添加甲基。 二代測序又可以稱之為什么?新疆嘉安健達(dá)二代測序價格
二代測序—全外顯子測序的應(yīng)用領(lǐng)域
醫(yī)學(xué)領(lǐng)域:1、疾病診斷:用于診斷各種遺傳性疾病,包括單基因遺傳?。ㄈ缒倚岳w維化、杜氏肌營養(yǎng)不良等)和復(fù)雜疾?。ㄈ?*、心血管疾病等)。在**研究中,通過對**組織和正常組織進(jìn)行全外顯子測序,可以發(fā)現(xiàn)腫瘤細(xì)胞中的體細(xì)胞突變,這些突變可能是導(dǎo)致**發(fā)生、發(fā)展的關(guān)鍵因素,有助于醫(yī)生制定個性化的治療方案。2、藥物研發(fā):幫助研究人員了解藥物靶點(diǎn)的基因變異情況。例如,如果發(fā)現(xiàn)某些患者的藥物靶點(diǎn)基因外顯子區(qū)域存在突變,可能會影響藥物的療效,從而可以針對性地開發(fā)新的藥物或者調(diào)整藥物的使用劑量和方式。
遺傳學(xué)研究:用于研究人類群體的遺傳多樣性,通過對不同人群的外顯子測序,可以發(fā)現(xiàn)不同人群之間的基因差異,這些差異可能與人群的適應(yīng)性、易感性等有關(guān)。還可以用于追蹤基因的進(jìn)化歷程,了解基因在進(jìn)化過程中的變化情況。 新疆哪里有二代測序原理二代測序可以應(yīng)用在哪些方面?
二代測序技術(shù)在不同人群中的準(zhǔn)確性有何差異④
***性疾病患者
優(yōu)勢:病原學(xué)二代測序可準(zhǔn)確檢測病原體的基因序**定病原體種類和基因型,為***性疾病的診斷和***提供依據(jù),在檢測罕見病原體、病毒***等方面具有獨(dú)特優(yōu)勢,有助于快速明確診斷,尤其是對于一些傳統(tǒng)檢測方法難以診斷的***性疾病,如不明原因的發(fā)熱、肺炎、腦膜炎等。
局限性:對于低豐度病原體,可能出現(xiàn)假陽性或假陰性結(jié)果。樣本質(zhì)量、測序深度和數(shù)據(jù)分析方法等因素也會影響準(zhǔn)確性,若樣本中病原體含量低或雜質(zhì)多,可能導(dǎo)致檢測失敗或結(jié)果不準(zhǔn)確
二代測序——技術(shù)原理類問題
二代測序與一代測序的區(qū)別是什么:一代測序技術(shù)如Sanger測序,一次只能讀取一條DNA序列,通量低、速度慢、成本高,但準(zhǔn)確性高,適用于對少量基因片段的精確測序。而二代測序技術(shù)具有高通量、速度快、成本低等優(yōu)點(diǎn),可以同時對大量DNA分子進(jìn)行測序,但在單個堿基的準(zhǔn)確性上稍低于一代測序,二者在不同的應(yīng)用場景中各有優(yōu)勢。二代測序有哪些主要的測序原理:主要包括邊合成邊測序和連接法測序。邊合成邊測序是在DNA聚合酶的作用下,逐個添加帶有熒光標(biāo)記的dNTP,通過檢測釋放的熒光信號來確定堿基序列;連接法測序則是利用DNA連接酶將寡核苷酸探針連接到模板DNA上,根據(jù)連接的探針序列來推斷模板DNA的堿基組成。 二代測序需要分析嗎?
二代測序—全外顯子測序的優(yōu)勢
針對性強(qiáng):它主要聚焦于基因組中編碼蛋白質(zhì)的區(qū)域,這部分區(qū)域雖然只占整個基因組的 1 - 2% 左右,但包含了大部分與疾病相關(guān)的突變。例如,在研究孟德爾遺傳病時,很多致病突變都位于外顯子區(qū)域,通過全外顯子測序可以更高效地找到這些突變。
成本效益高:相比于全基因組測序,全外顯子測序的成本相對較低。因?yàn)樗恍枰獙φ麄€基因組(包括大量的非編碼區(qū)域)進(jìn)行測序,在一定程度上減少了數(shù)據(jù)量和測序成本,同時又能獲取大部分有重要功能意義的遺傳信息。 二代測序的優(yōu)勢是高靈敏度。黑龍江哪里有二代測序
二代測序使用的是哪種設(shè)備?新疆嘉安健達(dá)二代測序價格
什么樣本可以做二代測序?③
細(xì)胞樣本
培養(yǎng)細(xì)胞:包括各種原代培養(yǎng)細(xì)胞和細(xì)胞系。在基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究中,對培養(yǎng)的細(xì)胞進(jìn)行測序可以了解細(xì)胞的基因特征和功能變化。例如,在研究細(xì)胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路時,對經(jīng)過特定刺激處理的培養(yǎng)細(xì)胞進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序,以分析基因表達(dá)的上調(diào)或下調(diào)情況。
脫落細(xì)胞:如痰液中的脫落細(xì)胞、尿液中的脫落細(xì)胞等。這些細(xì)胞可以用于某些疾病的篩查。例如,在肺*篩查中,對痰液中的脫落細(xì)胞進(jìn)行基因檢測,通過二代測序?qū)ふ曳?相關(guān)的基因突變,作為一種非侵入性的檢測方法。 新疆嘉安健達(dá)二代測序價格
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