什么樣本可以做二代測序?① 1、血液樣本 全血:這是最常見的樣本類型之一。血液中含有白細胞,其細胞核內(nèi)有完整的基因組DNA。通過提取白細胞中的DNA,可以進行全基因組測序、全外顯子組測序等。例如,在遺傳病的基因診斷中,抽取患者的全血,提取DNA后,對與疾病相關(guān)的基因或整個外顯子組進行測序,以尋找致病突變。 血漿/血清:其中含有游離的DNA(cfDNA)和RNA(cfRNA)。在**患者中,腫瘤細胞會釋放其DNA片段進入血液循環(huán),這些cfDNA被稱為循環(huán)**DNA(ctDNA)。通過對血漿中的ctDNA進行測序,可以實現(xiàn)**的早期篩查、***過程中的動態(tài)監(jiān)測等。例如,對于肺...
③二代測序一般多久出結(jié)果? 3、測序深度和覆蓋度要求 測序深度是指每個堿基被測序的平均次數(shù),覆蓋度是指測序獲得的堿基占整個基因組(或目標區(qū)域)的比例。如果要求高測序深度和高覆蓋度,比如進行**全基因組的深度測序(測序深度可能達到100X甚至更高),需要更長的測序時間來獲取足夠的數(shù)據(jù),并且后續(xù)的數(shù)據(jù)處理和分析也會更復(fù)雜。而對于一些簡單的基因篩查項目,測序深度要求較低(如10X-20X),相應(yīng)的測序和分析時間會縮短。例如,低深度全外顯子測序用于篩查常見突變,測序可能在3-5天完成;而高深度的全外顯子測序用于檢測低頻體細胞突變,可能需要7-10天甚至更久。 宏基因組測序也是二代測序。...
什么樣本可以做二代測序?② 組織樣本 新鮮組織:如手術(shù)切除的**組織、活檢組織等。新鮮組織樣本中的細胞完整性較好,能夠提供高質(zhì)量的DNA和RNA。在**研究中,對新鮮**組織進行全基因組測序、轉(zhuǎn)錄組測序等,可以深入了解**的基因突變、基因表達變化等情況。例如,在研究結(jié)直腸*的發(fā)病機制時,對手術(shù)切除的結(jié)直腸*組織及其*旁組織進行測序,比較兩者之間的差異,以發(fā)現(xiàn)**相關(guān)的基因變異和表達調(diào)控異常。 福爾馬林固定石蠟包埋(FFPE)組織:這是臨床上常用的保存組織樣本的方式。FFPE組織中的DNA和RNA會有一定程度的損傷和降解,但經(jīng)過適當?shù)奶崛『托迯?fù)處理后,仍然可以用于二代測序。...
二代測序——技術(shù)原理類問題 二代測序與一代測序的區(qū)別是什么:一代測序技術(shù)如Sanger測序,一次只能讀取一條DNA序列,通量低、速度慢、成本高,但準確性高,適用于對少量基因片段的精確測序。而二代測序技術(shù)具有高通量、速度快、成本低等優(yōu)點,可以同時對大量DNA分子進行測序,但在單個堿基的準確性上稍低于一代測序,二者在不同的應(yīng)用場景中各有優(yōu)勢。二代測序有哪些主要的測序原理:主要包括邊合成邊測序和連接法測序。邊合成邊測序是在DNA聚合酶的作用下,逐個添加帶有熒光標記的dNTP,通過檢測釋放的熒光信號來確定堿基序列;連接法測序則是利用DNA連接酶將寡核苷酸探針連接到模板DNA上,根據(jù)連接的探針...
二代測序的建庫步驟① 一、樣本準備 樣本采集:根據(jù)研究目的采**適的樣本,如血液、組織、細胞等。例如,在**研究中,可能會采集**組織和對應(yīng)的正常組織。對于血液樣本,一般采用靜脈穿刺采集外周血,收集在含有抗凝劑(如EDTA)的**管中,以防止血液凝固。組織樣本則需要在合適的條件下盡快處理,以保持核酸的完整性。如果是新鮮組織,可將其置于液氮中速凍,然后保存在-80℃冰箱中。 核酸提?。簭臉颖局刑崛「哔|(zhì)量的DNA或RNA。對于DNA提取,常用的方法有酚-氯仿抽提法和商業(yè)化的DNA提取試劑盒。酚-氯仿抽提法是利用酚和氯仿使蛋白質(zhì)變性,離心后使DNA處于水相,從而實現(xiàn)分離。試劑盒...
二代測序——蛋白質(zhì)甲基化 概念及位置:蛋白質(zhì)甲基化是指在蛋白質(zhì)的氨基酸殘基上添加甲基基團。常見的甲基化修飾位點包括精氨酸(Arg)和賴氨酸(Lys)殘基。 作用 1、調(diào)節(jié)蛋白質(zhì) - 蛋白質(zhì)相互作用:例如,組蛋白(染色體的組成成分)的甲基化可以改變?nèi)旧|(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能,影響基因的可及性。當組蛋白 H3 的賴氨酸殘基(如 H3K4、H3K9 等)發(fā)生甲基化時,會招募不同的蛋白質(zhì)復(fù)合物,從而***或抑制基因轉(zhuǎn)錄。2、調(diào)節(jié)酶的活性:某些酶的活性可以通過蛋白質(zhì)甲基化來調(diào)節(jié)。甲基化可能改變酶的活性中心的結(jié)構(gòu)或者影響其與底物的結(jié)合能力。 檢測方法:質(zhì)譜分析:這是一種***用于檢測蛋...
什么樣本可以做二代測序?③ 細胞樣本 培養(yǎng)細胞:包括各種原代培養(yǎng)細胞和細胞系。在基礎(chǔ)醫(yī)學研究中,對培養(yǎng)的細胞進行測序可以了解細胞的基因特征和功能變化。例如,在研究細胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路時,對經(jīng)過特定刺激處理的培養(yǎng)細胞進行轉(zhuǎn)錄組測序,以分析基因表達的上調(diào)或下調(diào)情況。 脫落細胞:如痰液中的脫落細胞、尿液中的脫落細胞等。這些細胞可以用于某些疾病的篩查。例如,在肺*篩查中,對痰液中的脫落細胞進行基因檢測,通過二代測序?qū)ふ曳?相關(guān)的基因突變,作為一種非侵入性的檢測方法。 二代測序即高通量測序技術(shù)。山東嘉安健達二代測序 二代測序技術(shù)在不同人群中的準確性有何差異② 遺傳病患者及攜帶者...
一代、二代、三代測序的技術(shù)原理和技術(shù)特點分別是什么? 技術(shù)原理: 一代—雙脫氧終止法 二代—橋式PCR+4色熒光可逆終止+激光掃描成像 三代—PacBio SMRT測序技術(shù) 技術(shù)特點: 一代—只能檢測序列一致的PCR產(chǎn)物;讀長可以較長,比如Sanger可以達到幾百bp;通量低,一次只能檢測少量的序列;成本低; 二代—可以并行測序;需要放大信號才能檢測;通量大,可以產(chǎn)生上G的reads;讀長較短,一-般是固定的,比如50、100、150、250等;成本較高 三代:可以并行測序;不需要放大信號,對單個分子進行測序;通量大,比如SequelII平臺...
二代測序的建庫步驟② 二、片段化處理 物理方法:超聲破碎是常用的物理片段化方法。它通過超聲波的高頻振動將核酸分子打斷成合適大小的片段。例如,在一些文庫構(gòu)建中,將DNA樣本置于超聲破碎儀中,通過調(diào)整超聲功率和時間,可以將DNA片段化到幾百堿基對(bp)的長度范圍,一般在150-300bp左右,這符合二代測序的讀長要求。超聲破碎的優(yōu)點是片段大小比較均勻,但操作需要優(yōu)化超聲參數(shù),否則可能會導(dǎo)致過度破碎或片段大小不一致。 酶切方法:利用限制性內(nèi)切酶進行片段化。限制性內(nèi)切酶能夠識別特定的DNA序列,并在這些序列處切割DNA。例如,用EcoRⅠ酶可以識別GAATTC序列并進行切割。通...
二代測序的建庫步驟① 一、樣本準備 樣本采集:根據(jù)研究目的采**適的樣本,如血液、組織、細胞等。例如,在**研究中,可能會采集**組織和對應(yīng)的正常組織。對于血液樣本,一般采用靜脈穿刺采集外周血,收集在含有抗凝劑(如EDTA)的**管中,以防止血液凝固。組織樣本則需要在合適的條件下盡快處理,以保持核酸的完整性。如果是新鮮組織,可將其置于液氮中速凍,然后保存在-80℃冰箱中。 核酸提取:從樣本中提取高質(zhì)量的DNA或RNA。對于DNA提取,常用的方法有酚-氯仿抽提法和商業(yè)化的DNA提取試劑盒。酚-氯仿抽提法是利用酚和氯仿使蛋白質(zhì)變性,離心后使DNA處于水相,從而實現(xiàn)分離。試劑盒...
二代測序——基因組測序該測幾個G?② 人類全外顯子組測序 人類全外顯子組*占基因組的1%-2%,大小約為30M-60M左右,但通常需要較高的測序深度來確保外顯子區(qū)域的變異檢測準確性,一般測序深度在100X-200X之間,數(shù)據(jù)量大約在3G-12G左右。全外顯子組測序主要關(guān)注編碼蛋白質(zhì)的外顯子區(qū)域,能夠高效地檢測出與疾病相關(guān)的基因突變,常用于遺傳病的診斷、**基因突變篩查等研究。 動植物基因組測序 常見動植物:對于一些常見的動植物物種,如水稻、小鼠等,其基因組大小與人類基因組相近或更小。全基因組測序時,測序深度一般在10X-30X左右,數(shù)據(jù)量在30G-90G之間。如果是...
二代測序的優(yōu)勢和劣勢分別有哪些? 優(yōu)勢:能夠同時得到大量的序列數(shù)據(jù),相比于一代測序技術(shù),通量提高了成千上萬倍;單條序列成本非常低廉。 劣勢:序列讀長較短,Illumina平臺為250-300bp,454平臺也只有500bp左右;由于建庫中利用了PCR富集序列,因此有一些含量較少的序列可能無法被大量擴增,造成一些信息的丟失,且PCR過程中有一定概率會引入錯配堿基。想要得到準確和長度較長的拼接結(jié)果,需要測序的覆蓋率較高導(dǎo)致結(jié)果錯誤較多和成本增加。 一代、二代、三代測序的區(qū)別是什么?黑龍江哪里有二代測序流程 二代測序—全外顯子測序的優(yōu)勢 針對性強:它主要聚焦于基因組中編碼蛋白...
二代測序——轉(zhuǎn)錄組測序的背景和基本原理 1、背景:在基因表達過程中,DNA 轉(zhuǎn)錄為 RNA,轉(zhuǎn)錄后的 RNA 會經(jīng)過一系列加工,包括剪接等過程形成成熟的 mRNA,然后進行翻譯產(chǎn)生蛋白質(zhì)。轉(zhuǎn)錄組測序可以讓我們在全基因組范圍內(nèi)研究基因的表達情況,相比于傳統(tǒng)的基因表達研究方法(如芯片技術(shù)),它具有更高的分辨率和更廣的檢測范圍。 2、原理:首先從樣本(如細胞、組織)中提取總 RNA,然后將 RNA 反轉(zhuǎn)錄為 cDNA(互補 DNA)。這些 cDNA 會構(gòu)建測序文庫,在文庫中加入特定的接頭序列,以便后續(xù)在測序平臺上進行測序。測序過程中,測序儀會讀取 cDN**段的堿基序列信息。通過生物...
不同二代測序技術(shù)平臺的速度 Illumina 測序平臺:這是目前市場上應(yīng)用較為***的二代測序平臺之一,其測序速度較快。例如 Illumina NovaSeq 系列,一次運行可以在 1-3 天內(nèi)產(chǎn)生大量的數(shù)據(jù),通量可達數(shù)億甚至數(shù)十億條讀長,能夠滿足大規(guī)?;蚪M學研究和臨床檢測的需求。 Roche 454 測序平臺:Roche 454 測序系統(tǒng)的測序速度也較快,其特點是測序片段比較長,高質(zhì)量的讀長能達到 400bp 左右,一次運行可以在 24 小時左右完成對一定數(shù)量樣本的測序。 BGISEQ 系列:華大智造的 BGISEQ 系列測序儀在速度上也有出色表現(xiàn),如全球二代測序速度...
二代測序——RNA甲基化的概念、作用和檢測方法 RNA 甲基化概念及位置:RNA 甲基化是在 RNA 分子上添加甲基基團,其中 N6 - 甲基腺苷(m6A)是最常見的一種 RNA 甲基化修飾形式,它主要發(fā)生在 mRNA(信使 RNA)的腺嘌呤(A)殘基上。 作用 1、影響 RNA 的穩(wěn)定性:m6A 修飾可以影響 mRNA 的穩(wěn)定性。例如,一些帶有 m6A 修飾的 mRNA 更容易被降解,從而調(diào)控基因表達的時間和水平。2、調(diào)節(jié) RNA 的剪接和翻譯:m6A 修飾還能夠調(diào)節(jié) mRNA 的剪接過程,影響不同轉(zhuǎn)錄本的生成。同時,它也可以在翻譯水平上發(fā)揮作用,影響蛋白質(zhì)合成的效率。...
二代測序的應(yīng)用領(lǐng)域有哪些? 基因組學研究:用于全基因組測序,快速獲取物種的基因組序列信息,研究基因組結(jié)構(gòu)、變異、進化等;進行全外顯子組測序,重點關(guān)注編碼蛋白質(zhì)的外顯子區(qū)域,發(fā)現(xiàn)與疾病相關(guān)的基因突變。 轉(zhuǎn)錄組學研究:通過對轉(zhuǎn)錄組進行測序,可分析基因的表達水平、可變剪接、新轉(zhuǎn)錄本發(fā)現(xiàn)等,有助于深入了解基因在不同生理和病理狀態(tài)下的表達調(diào)控機制。 疾病診斷與***:在遺傳病診斷中,能夠檢測出導(dǎo)致遺傳病的基因突變,為疾病的診斷、遺傳咨詢和產(chǎn)前診斷提供依據(jù);在**研究中,可分析腫瘤細胞的基因突變、拷貝數(shù)變異、基因融合等,為**的早期診斷、靶向***和預(yù)后評估提供支持。 藥物研發(fā)...
二代測序——轉(zhuǎn)錄組測序的實驗流程(下) 測序 根據(jù)研究需求和預(yù)算選擇合適的測序平臺,如 Illumina 測序平臺。它的測序原理主要是邊合成邊測序(SBS)。在測序過程中,dNTP(脫氧核糖核苷三磷酸)帶有不同顏色的熒光標記,當新的 dNTP 加入到正在合成的 DNA 鏈時,通過檢測熒光信號來確定堿基類型,從而讀取 cDN**段的序列。測序深度(覆蓋度)也是一個重要參數(shù),一般來說,測序深度越高,檢測到的低表達轉(zhuǎn)錄本的概率就越大,但成本也會相應(yīng)增加。 數(shù)據(jù)分析 數(shù)據(jù)質(zhì)量控制是第一步,要去除低質(zhì)量的 reads(如含有較多不確定堿基 “N” 的 reads)和接頭序列。...
二代測序技術(shù)在不同人群中的準確性有何差異① **患者 優(yōu)勢:對于**患者,二代測序技術(shù)準確性相對較高,在**的診斷、***及監(jiān)測等方面應(yīng)用***。比如肺*患者,通過檢測**組織或血液中的基因突變,可準確找到如EGFR、ALK等驅(qū)動基因突變,為靶向***提供依據(jù),其準確率通常在90%以上。在軟組織**中,二代測序能檢測到**組織的基因信息,包括突變基因、基因表達情況等,幫助醫(yī)生更準確地診斷病情,并制定個性化的***方案。 局限性:腫瘤細胞的異質(zhì)性會影響檢測準確性,若樣本中腫瘤細胞比例低或存在多種類型細胞,可能導(dǎo)致部分基因突變漏檢,影響對**基因組全貌的評估。此外,血液樣本中...
④二代測序一般多久出結(jié)果? 4、數(shù)據(jù)分析的復(fù)雜程度 數(shù)據(jù)分析是二代測序的重要環(huán)節(jié)。簡單的分析,如檢測已知的單核苷酸多態(tài)性(SNP),可以通過與參考基因組比對后利用一些成熟的軟件快速完成。但如果是進行復(fù)雜的分析,如尋找新的基因融合事件、復(fù)雜結(jié)構(gòu)變異的檢測或者進行從頭組裝(denovoassembly),則需要更復(fù)雜的算法和更多的計算資源,花費的時間可能從數(shù)天到數(shù)周。例如,對于常規(guī)的SNP檢測和注釋,數(shù)據(jù)分析可能在1-3天內(nèi)完成;而對于**樣本中復(fù)雜的基因融合分析,可能需要3-7天甚至更長時間來確保結(jié)果的準確性。 二代測序的優(yōu)勢是高準確性。江蘇二代測序檢測 二代測序的優(yōu)勢和劣勢分...
什么樣本可以做二代測序?① 1、血液樣本 全血:這是最常見的樣本類型之一。血液中含有白細胞,其細胞核內(nèi)有完整的基因組DNA。通過提取白細胞中的DNA,可以進行全基因組測序、全外顯子組測序等。例如,在遺傳病的基因診斷中,抽取患者的全血,提取DNA后,對與疾病相關(guān)的基因或整個外顯子組進行測序,以尋找致病突變。 血漿/血清:其中含有游離的DNA(cfDNA)和RNA(cfRNA)。在**患者中,腫瘤細胞會釋放其DNA片段進入血液循環(huán),這些cfDNA被稱為循環(huán)**DNA(ctDNA)。通過對血漿中的ctDNA進行測序,可以實現(xiàn)**的早期篩查、***過程中的動態(tài)監(jiān)測等。例如,對于肺...
二代測序——甲基化的定義和概念 定義:甲基化(methylation)是指從活性甲基化合物(如S-腺苷基甲硫氨酸)上將甲基催化轉(zhuǎn)移到其他化合物的過程。在生物系統(tǒng)中,這是一種常見的化學修飾方式,主要涉及在DNA、RNA和蛋白質(zhì)等生物大分子上添加甲基基團。 DNA甲基化 概念及位置:DNA甲基化主要是在DNA甲基轉(zhuǎn)移酶(DNAmethyltransferase,DNMT)的作用下,將甲基基團添加到DNA分子中的特定堿基上,最常見的是在CpG島(富含CpG二核苷酸的區(qū)域,CpG是指胞嘧啶-鳥嘌呤的堿基對)的胞嘧啶(C)的5’碳位上添加甲基。 RNA測序也是二代測序。湖南二代測序...
①二代測序一般多久出結(jié)果? 二代測序(Next-GenerationSequencing,NGS)出結(jié)果的時間會受到多種因素的影響,一般在數(shù)天到數(shù)周不等。 1、樣本類型和質(zhì)量 不同的樣本類型處理時間不同。例如,血液樣本相對容易處理,提取DNA的過程比較常規(guī)。如果是組織樣本,可能需要先進行樣本的解離等復(fù)雜操作。如果樣本質(zhì)量高,DNA提取和文庫構(gòu)建等前期工作會比較順利,能加快整體進程。但如果樣本量少或者DNA有降解等質(zhì)量問題,可能需要重新提取樣本或者進行DNA修復(fù)等操作,這會**延長時間。例如,對于新鮮血液樣本,DNA提取可能在1-2天內(nèi)完成;而對于一些福爾馬林固定石蠟包埋(...
二代測序的建庫步驟⑤ 五、文庫富集(可選步驟) PCR富集:對于一些起始樣本量較少或者連接效率較低的情況,可能需要進行PCR富集。利用與接頭序列互補的引物進行PCR擴增,增加文庫中目標DNA片段的數(shù)量。在PCR反應(yīng)中,需要注意引物的設(shè)計要與接頭序列準確匹配,并且要優(yōu)化PCR循環(huán)數(shù),避免過度擴增導(dǎo)致文庫多樣性降低或引入PCR偏差。一般會通過預(yù)實驗確定合適的PCR循環(huán)數(shù),例如從10-15個循環(huán)開始嘗試,通過檢測擴增產(chǎn)物的量和質(zhì)量來調(diào)整循環(huán)數(shù)。 擴增子測序是二代測序嗎?四川哪里有二代測序分析 二代測序技術(shù)在不同人群中的準確性有何差異③ 孕婦及胎兒 優(yōu)勢:無創(chuàng)產(chǎn)前篩查(N...
二代測序不同應(yīng)用場景下的速度有多快? 病原微生物檢測:一般來說,二代測序用于檢測病原微生物時,能夠在幾個小時到一天左右出結(jié)果。比如在快速檢測血液中的病原微生物時,通??梢栽趲讉€小時內(nèi)獲得檢測結(jié)果,相比傳統(tǒng)的血液培養(yǎng)方法,時間大幅縮短,傳統(tǒng)血液培養(yǎng)一般需要幾天到一周的時間 。 全基因組測序:如果是對人類全基因組進行測序,以目前的技術(shù)水平,使用二代測序技術(shù)完成一個人的全基因組測序,一般需要 1-2 天左右的時間。而在十幾年前,人類全基因組測序計劃***完成時,耗費了大量的時間和精力,相比之下二代測序技術(shù)的速度提升***。 轉(zhuǎn)錄組測序:轉(zhuǎn)錄組測序的時間相對較短,一般幾個小時內(nèi)可...
不同二代測序技術(shù)平臺的速度 Illumina 測序平臺:這是目前市場上應(yīng)用較為***的二代測序平臺之一,其測序速度較快。例如 Illumina NovaSeq 系列,一次運行可以在 1-3 天內(nèi)產(chǎn)生大量的數(shù)據(jù),通量可達數(shù)億甚至數(shù)十億條讀長,能夠滿足大規(guī)模基因組學研究和臨床檢測的需求。 Roche 454 測序平臺:Roche 454 測序系統(tǒng)的測序速度也較快,其特點是測序片段比較長,高質(zhì)量的讀長能達到 400bp 左右,一次運行可以在 24 小時左右完成對一定數(shù)量樣本的測序。 BGISEQ 系列:華大智造的 BGISEQ 系列測序儀在速度上也有出色表現(xiàn),如全球二代測序速度...
不同二代測序技術(shù)平臺的速度 Illumina 測序平臺:這是目前市場上應(yīng)用較為***的二代測序平臺之一,其測序速度較快。例如 Illumina NovaSeq 系列,一次運行可以在 1-3 天內(nèi)產(chǎn)生大量的數(shù)據(jù),通量可達數(shù)億甚至數(shù)十億條讀長,能夠滿足大規(guī)?;蚪M學研究和臨床檢測的需求。 Roche 454 測序平臺:Roche 454 測序系統(tǒng)的測序速度也較快,其特點是測序片段比較長,高質(zhì)量的讀長能達到 400bp 左右,一次運行可以在 24 小時左右完成對一定數(shù)量樣本的測序。 BGISEQ 系列:華大智造的 BGISEQ 系列測序儀在速度上也有出色表現(xiàn),如全球二代測序速度...
二代測序——技術(shù)原理類問題 二代測序與一代測序的區(qū)別是什么:一代測序技術(shù)如Sanger測序,一次只能讀取一條DNA序列,通量低、速度慢、成本高,但準確性高,適用于對少量基因片段的精確測序。而二代測序技術(shù)具有高通量、速度快、成本低等優(yōu)點,可以同時對大量DNA分子進行測序,但在單個堿基的準確性上稍低于一代測序,二者在不同的應(yīng)用場景中各有優(yōu)勢。二代測序有哪些主要的測序原理:主要包括邊合成邊測序和連接法測序。邊合成邊測序是在DNA聚合酶的作用下,逐個添加帶有熒光標記的dNTP,通過檢測釋放的熒光信號來確定堿基序列;連接法測序則是利用DNA連接酶將寡核苷酸探針連接到模板DNA上,根據(jù)連接的探針...
二代測序——蛋白質(zhì)甲基化 概念及位置:蛋白質(zhì)甲基化是指在蛋白質(zhì)的氨基酸殘基上添加甲基基團。常見的甲基化修飾位點包括精氨酸(Arg)和賴氨酸(Lys)殘基。 作用 1、調(diào)節(jié)蛋白質(zhì) - 蛋白質(zhì)相互作用:例如,組蛋白(染色體的組成成分)的甲基化可以改變?nèi)旧|(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能,影響基因的可及性。當組蛋白 H3 的賴氨酸殘基(如 H3K4、H3K9 等)發(fā)生甲基化時,會招募不同的蛋白質(zhì)復(fù)合物,從而***或抑制基因轉(zhuǎn)錄。2、調(diào)節(jié)酶的活性:某些酶的活性可以通過蛋白質(zhì)甲基化來調(diào)節(jié)。甲基化可能改變酶的活性中心的結(jié)構(gòu)或者影響其與底物的結(jié)合能力。 檢測方法:質(zhì)譜分析:這是一種***用于檢測蛋...
二代測序——甲基化的定義和概念 定義:甲基化(methylation)是指從活性甲基化合物(如S-腺苷基甲硫氨酸)上將甲基催化轉(zhuǎn)移到其他化合物的過程。在生物系統(tǒng)中,這是一種常見的化學修飾方式,主要涉及在DNA、RNA和蛋白質(zhì)等生物大分子上添加甲基基團。 DNA甲基化 概念及位置:DNA甲基化主要是在DNA甲基轉(zhuǎn)移酶(DNAmethyltransferase,DNMT)的作用下,將甲基基團添加到DNA分子中的特定堿基上,最常見的是在CpG島(富含CpG二核苷酸的區(qū)域,CpG是指胞嘧啶-鳥嘌呤的堿基對)的胞嘧啶(C)的5’碳位上添加甲基。 二代測序又可以稱之為什么?新疆嘉安健...
二代測序——甲基化的作用和檢測方法有哪些? 作用 基因表達調(diào)控:DNA 甲基化通常與基因沉默有關(guān)。例如,在**發(fā)生過程中,某些抑*基因的啟動子區(qū)域(調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄起始的 DNA 序列)可能會發(fā)生高甲基化,導(dǎo)致這些基因無法正常表達,從而失去對腫瘤細胞生長的抑制作用。 發(fā)育調(diào)控:在胚胎發(fā)育過程中,DNA 甲基化模式的動態(tài)變化對于細胞分化和組織***形成至關(guān)重要。不同的細胞類型具有特定的 DNA 甲基化圖譜,這些圖譜引導(dǎo)細胞向特定的方向分化。 檢測方法 亞硫酸鹽測序法:這是一種能夠精確檢測 DNA 甲基化狀態(tài)的方法。其原理是利用亞硫酸鹽處理 DNA,未甲基化的胞嘧啶會...